تقع مدرسة ذكور
فرعون الأساسية إلى الغرب من قرية فرعون، وتشرف بشكل مباشر على البحر الأبيض
المتوسط، وهي محاذية لحدود الخامس من حزيران، عام 1967م. ومحاذية تماماً لجدار
الفصل الذي تم إنشاؤه في عام 2002م.
تأسست المدرسة
عام 2004م، وبدأت من الصفوف الأول الأساسي حتى الرابع الأساسي. وهي مجاورة تماما
لمدرسة ذكور فرعون الثانوية ويشترك بعض المعلمين في المدرستين بنفس اليوم.
تعاقب على
إدارتها عدد من المديرين، وكان أولهم الأستاذ مراد دريدي، وبقي فيها حتى العام
الدراسي 2008-2009, ثم تلاه الأستاذ محمد رجب، وبقي فيها إلى عام 2010-2011م، ثم
جاء بعده الأستاذ مالك صباح بتاريخ 4/9/2011م.